Né en République sud-africaine, il y a fait toutes ses classes ainsi que ses études de théologie. Son enracinement dans la terre sud-africaine a conditionné toute sa vie et son ministère.

Lle Conseil de la Mission Suisse en Afrique du Sud l’engage en 1959, l’année même où il est consacré au ministère pastoral dans le cadre de la Tsonga Presbyterian Church qui devint plus tard l’Evangelical Presbyterian Church of South Africa. De 1959 à 1964, Jean-François Bill fut aumônier de l’Ecole normale de Lemana à Elim, puis il se rendit aux USA pour un séjour d’études au séminaire théologique de Chicago où il fit des rencontres décisives pour l’orientation que prendra son ministère. En effet, il eut pour camarades d’études de futurs leaders de la lutte des Noirs américains pour l’accession à leurs droits civiques et politiques. Il eut même l’occasion d’entendre le pasteur Martin Luther King. De 1965 à 1970, il fut pasteur de paroisse à Elim et Pretoria, puis de 1971 à 1979 il enseigna au « Federal Theological Seminary » à Alice puis à Edendale. Son engagement dans la résistance au régime d’apartheid lui vaudra d’être emprisonné pendant 9 mois dans la sinistre prison de Johannesburg. De 1992 à 1993, il fut directeur administratif du Centre de santé d’Alexandra, un des bidonvilles de Johannesburg. De 1993 à 1997, il devint le directeur de « Fundani », une association chargée de gérer les fonds destinés à des bourses pour étudiants défavorisés.